Prof. dr. van der Velden is sinds 2014 coördinator van het Double Dose onderzoeksconsortium dat zich richt op aangeboren en genetische hartaandoeningen. De studies binnen dit consortium concentreren zich o.a. op de metabole stress in de hartspier.

Zij leidt de afdeling Fysiologie van het Amsterdam UMC en is directeur van het Amsterdam Cardiovascular Sciences Institute. Haar eigen onderzoek is gericht op cel-dysfunctie bij erfelijke hartspierziekten en het identificeren van de abnormale mechanismen waarvoor zij nieuwe medicatie wilt ontwikkelen.